九寨沟的海拔约达 3000 米。
九寨沟自然保护区的地势呈现出南高北低的态势,山谷深邃,高差极为悬殊。在区域的北缘,九寨沟口的海拔仅仅 2000 米,中部的峰岭普遍在 4000 米之上,南缘更是达到了 4500 米以上,主沟的长度超过 30 公里。峰顶和两侧的山峰基本上终年被积雪覆盖。九寨沟处于青藏高原向四川盆地过渡的地带,其地质背景复杂多样,碳酸盐分布广泛,褶皱和断裂发育显著,新构造运动强烈,地壳抬升的幅度较大。多种营力相互交错复合,塑造出了丰富多样的地貌形态,发育了大规模喀斯特作用下的钙华沉积,以植物喀斯特钙华沉积为主导,从而形成了九寨沟那艳丽典雅的群湖、奔泻湍急的溪流、飞珠溅玉的瀑群、古穆幽深的林莽以及连绵起伏的雪峰。